Gel elektroforezi həm üfüqi, həm də şaquli istiqamətdə aparıla bilər. Horizontal gellər adətən agaroz matrisindən ibarətdir. Bu gellərin məsamə ölçüləri kimyəvi komponentlərin konsentrasiyasından asılıdır: agaroz gel məsamələri (diametri 100-500 nm) akrilamid gelpores (diametri 10-200 nm) ilə müqayisədə daha böyük və daha az vahiddir. Müqayisəli olaraq, DNT və RNT molekulları, bu prosesdən əvvəl və ya proses zamanı tez-tez denatürasiya edilən xətti zülal zəncirindən daha böyükdür, bu da onları təhlil etməyi asanlaşdırır. Beləliklə, DNT və RNT molekulları daha tez-tez agaroz gellərində (üfüqi) işlədilir. Bizim DYCP-31DN sistemimiz üfüqi elektroforez sistemidir. Bu qəliblənmiş gel tökmə cihazı müxtəlif gel qabları ilə 4 müxtəlif ölçüdə gel hazırlaya bilir.
