Elektroforez sistemi iki əsas komponentdən ibarətdir: enerji təchizatı və elektroforez kamerası. Enerji təchizatı enerji təchizatını təmin edir. Bu vəziyyətdə "güc" elektrikdir. Enerji təchizatından gələn elektrik bir istiqamətdə, elektroforez kamerasının bir ucundan digərinə axır. Kameranın katod və anodu əks yüklü hissəcikləri cəlb edir.
Elektroforez kamerasının içərisində bir qab var - daha dəqiq desək, tökmə qabı. Tökmə qabı aşağıdakı hissələrdən ibarətdir: tökmə qabının dibinə daxil olan şüşə boşqab. Gel tökmə qabında saxlanılır. "Daraq" öz adına bənzəyir.Daraq tökmə qabının yan tərəfindəki yuvalara yerləşdirilir.İsti, ərinmiş gel tökülməzdən ƏVVƏL yuvalara qoyulur. Gel bərkidikdən sonra daraq çıxarılır. Darağın "dişləri" geldə "quyu" dediyimiz kiçik deşiklər buraxır. Quyular isti, ərimiş gel tarağın dişləri ətrafında bərkidikdə hazırlanır. Gel soyuduqdan sonra daraq çıxarılır, quyular qalır. Quyular sınaqdan keçirmək istədiyiniz hissəcikləri yerləşdirmək üçün bir yer təmin edir. Bir şəxs hissəcikləri yükləyərkən geli pozmamaq üçün çox diqqətli olmalıdır. Gelin çatlaması və ya qırılması çox güman ki, nəticələrinizə təsir edəcək.